Почему веб-версия работает, а клиент не синхронизирует файлы?
Десктопный клиент использует собственные соединения и отдельные адреса для передачи данных. Работающий браузер подтверждает только доступность веб-интерфейса, но ничего не говорит о каналах синхронизации.